Тайваньская наёмница по прозвищу Стеклянное Сердце решает свести счёты с жизнью, бросившись с высотного здания. Но судьба распоряжается иначе — вместо мгновенной смерти она оказывается пронзённой металлическими прутьями ограды, что приводит к тяжёлой травме сердца. Благодаря экстренной пересадке донорского органа девушка выживает, однако во время комы её посещают загадочные видения. Эти сны становятся путеводной нитью, ведущей её в Японию, где она начинает поиски человека, чьё сердце теперь бьётся в её груди — Каори Макимуры, бывшей напарницы легендарного Городского охотника.
Создатели подчёркивают, что "Сердце ангела" — это самостоятельная история, использующая лишь образы персонажей из "Городского охотника", но не являющаяся его прямым продолжением. Действие разворачивается в альтернативной реальности, где судьбы героев складываются совершенно иначе. Хотя фанаты узнают знакомые лица, сюжетная линия и характеры персонажей существенно отличаются от оригинальной манги, предлагая зрителям свежий взгляд на уже полюбившихся героев.
История Стеклянного Сердца — это путь самопознания, наполненный драматическими поворотами и философскими размышлениями о ценности жизни. Столкнувшись с чужими воспоминаниями и эмоциями, героиня вынуждена переосмыслить своё прошлое и найти новый смысл существования. Её поиски приводят к неожиданным встречам, раскрывающим тайны как её собственной души, так и людей, с которыми её теперь связывает незримая нить судьбы.